南台科大因應武漢肺炎疫情發展，分階段調整防疫措施和作為，建置「南台QR Code簽到系統」，支援防疫期間上課、開會及洽公等線上簽到，記錄每個人的校園足跡，以提供師生安心工作和就學的環境。
南台積極宣導防疫，並建置QR Code簽到系統，以因應有確診案例出現時，可立即調閱接觸者名單，提供衛生單位防疫醫師匡列居家隔離和自主健康管理者的名單。
此外，南台並實施校園每日消毒教室、廁所、電梯、餐廳、圖書館、體能運動中心、辦公等公共空間，並提供充足洗手乳，讓師生可落實勤洗手，降低接觸感染的風險。為了讓師生安心用餐，學生進入餐廳前須用酒精消毒雙手，點餐時須戴口罩，並在每個桌上放置「用餐勿語」的警語。
為掌握全校教職員生居家隔離、檢疫、自主健康管理、發燒等狀況，南台計網中心協助建置個案通報及體溫追蹤線上系統，導師、校護和校安人員須每日關心班上被列管學生的身體狀況，上系統填報每日量體溫二次，及通報教育部各類列管人數。
南台校長盧燈茂表示，該校為維護教職員生的健康安全，與政府防疫政策緊密配合，在國際上武漢肺炎疫情持續升溫，許多國家疫情幾近失控的情況下，更應落實防疫工作的每個細節，群策群力做好防疫工作，共同保護家園。
