兼任民進黨主席的賴清德總統日前對民進黨立委下達軍令狀，要求所有黨籍立委全程參與包括程序委員會、八大委員會、院會等立法院各種會議。第二天的院會，民進黨團就有三十人未出席。這不僅是公然打臉賴清德，也顯示民進黨內的派系矛盾，非但沒有平息，而且暗潮洶湧。
賴清德當選總統後，「一統天下」，掌控大局的企圖心十分明顯，不僅全面主導內閣人事，對立法院的運作也著墨甚深；經常「關切」國會議事，遇有重大議案還公開下達指令。
不久之前，總預算案被在野黨聯手退回程序委員會，賴清德就提出三點指示，要求黨團會議召開時，所有成員要全員到場、全程參加；程序委員會、八大常設委員會、立法院會也要全程參與，並且全面服從黨團指揮。
賴清德的全員出席令言猶在耳，但第二天的立法院院會，據國民黨立委統計，民進黨僅有二十一人出席，只占黨團成員的百分之四十一，連總召柯建銘都缺席。在此之前，賴清德宴請全體黨籍立委，為新會期加油打氣，也有十二人未到。這縱然不能解讀為民進黨部分立委「不甩」賴清德，但至少證明民進黨立委並未全部對賴清德俯首聽命，其原因自然值得探究。
民進黨以往一向有「派系共治」的傳統，蔡英文上台之初，由於沒有派系奧援，就與新潮流合作，導致新潮流逐漸坐大；賴清德上台後，蓄意培植親信，這種情形更為嚴重。五十一名立委中，新潮流就有十八人，再加親賴派系，總數超過六成；中常委與中執委中，親賴勢力同樣也在六成上下；而行政院各部會及國營事業，更充斥賴系與台南幫人馬。這就造成其他派系的不滿，但又憚於政治現實，不敢公然跟賴清德作對，只能暗中抵制，或消極的不合作，立委的態度當然反映派系的立場。
值得注意的是，賴清德與蔡英文在二０一九年黨內初選殺到刀刀見骨，今年五二０後雙方矛盾不僅沒有化解，甚至變本加厲，賴清德第一刀就砍向蔡英文屬意的大阿哥鄭文燦，動作之大令英系人人自危；而原本跟賴清德策略聯盟的正國會，在選舉競爭與資源分配不均的諸多因素下，也對賴清德不無怨言。這次未出席餐會與院會的立委中，許多屬於英系與正國會，就可見一斑。
更重要的是，賴、柯之間現在似乎也出現矛盾。賴清德曾推崇柯建銘是他所見「最認真、最仔細的立委，也是最有戰略、戰術的政治領導者」，足見兩人關係不壞。但在鄭文燦被捕後，坊間就有「下一刀恐怕是柯建銘」的小道消息，七月又傳出賴清德有意「換總召」。隨後在民進黨中常會中，針對台灣社會「情緒教育」議題報告，柯建銘除了指出「領導者都蠻適合這樣的課程」，還向賴清德說「我不是針對你」。這些跡象都顯示，兩人之間的關係似已出現微妙變化。
今年六月，柯建銘拜會蔡英文，請益國會不過半困境如何解決，事後他在臉書發文，聲稱他與蔡英文認識將近三十年，是他與所有民進黨同志中「認識最久，也並肩作戰最久，而且未來也會繼續為台灣努力的永遠戰友」。耐人尋味的是，兩天後他將蔡英文提出的三點「提示及叮嚀」刪除。可以想見，柯建銘與蔡英文的互動，既使賴清德忌憚，也導致賴柯矛盾擴大，更是他至今未能掌控民進黨立院黨團的重要因素。