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分析上億條降解片段 中研院破解RNA死亡時間

中研院農業生物科技研究中心副研究員陳荷明(前中)及研究團隊近日利用上億條的RNA降解片段定序資料,首次破解RNA的「死亡時間」,證明許多「有問題」的RNA會在首次轉譯過程中被細胞偵測異常並將其降解。 (中研院提供)
 記者陳柏翰/台北報導
 RNA(核糖核酸)降解機制可調控基因表現量,也能啟動防禦反應抵抗病原菌入侵。中央研究院研究團隊近日分析上億條的RNA降解片段定序資料,破解降解死亡發生時間及機制。
 細胞裡的RNA壽命短暫,其中含有正確基因密碼的RNA能存活並用於製造蛋白質,但帶有錯誤訊息的RNA則會被細胞酵素降解死亡。不過機制何時發生、引發降解的因子為何,過去尚未被完全理解。
 然而,中研院農業生物科技研究中心副研究員陳荷明研究團隊,利用上億條的RNA降解片段定序資料,首次破解RNA的死亡時間,證明許多有問題的RNA會在首次轉譯過程中被細胞偵測異常並將其降解。
 中研院表示,細胞會解碼RNA的核酸語言,並藉由轉譯作用來製造蛋白質。通常RNA在經過第一次轉譯後,附著在RNA上的外顯子連接複合體就會被移除,但若細胞檢查發現RNA包含錯誤序列,就會讓轉譯暫停。
 因此,當RNA死亡片段含有外顯子連接複合體,表示其死亡時間發生在第一次轉譯完成前。研究團隊從RNA降解片段裡找到外顯子連接複合體存在的證據。
 陳荷明也提到,植物細胞內執行RNA降解機制,若過量表達防禦相關基因,可能造成植物生長遲滯、細胞凋亡,因此研究RNA降解,有助於增進對農作物防禦機制的了解,以及開發調控基因表達的方法,為農業生物科技的發展提供新的工具及方向。